Bienvenue sur le nouveau site de Gustave Roussy
Un nouveau site pensé pour vous offrir une expérience plus simple, plus claire et plus intuitive. Patients, aidants, professionnels, donateurs : retrouvez plus facilement les informations, les actualités et les services.
PCCR : Plateforme Cellules Circulantes Rares
Unité mixte de service de rattachement
US23 – AMMICa
Type de plateforme
Plateforme translationnelle
Responsable scientifique
Pr Marianne Oulhen
Thématiques de recherche
Cytométrie, Génomique, Imagerie cellulaire, Microscopie, Modèles, Protéomique, Single-cell, Transcriptomique
Tutelles
Résumé
La plateforme CCR est dédiée à l’analyse phénotypique et moléculaire de cellules extrêmement rares présentes dans le sang, telles que les cellules tumorales circulantes (CTC). Notre laboratoire a acquis une expérience mondialement reconnue dans le domaine, par la publication de nombreux articles portant sur la détection et la caractérisation de ces cellules.
Dans le cadre d’essais cliniques, elle évalue différents biomarqueurs (cibles thérapeutiques, récepteurs de tyrosine kinase, voix de signalisation, réparation de l’ADN) non-invasifs de réponse aux traitements dans les CTC.
Les objectifs sont (I) de compter et caractériser les CTC détectées à différents moments du parcours clinique des patients, (II) d’estimer la bio-activité précoce des traitements, (III) de prédire la sensibilité ou la résistance aux thérapies, et (IV) de mieux comprendre la progression tumorale.
La plateforme s’appuie sur des technologies de pointe : Microscopie (analyses de marquages immunofluorescents et FISH), cytométrie en flux (détection et isolement cellulaire à l’échelle de cellule unique, analyses multi-protéines), et séquençage de cellules uniques (ciblé, exome entier, génome entier, transcriptome). Elle développe des projets innovants comme les xénogreffes à partir de CTC (CDX) ou encore la culture sur membrane chorioallantoïque (CAM) de l’embryon de poulet pour modéliser les tumeurs et tester l’activité thérapeutique. Des modèles murins sont utilisés pour valider les données issues de la biopsie liquide.
Programmes de recherche et initiatives
Notre laboratoire est affilié à l’IHU PRISM en lien avec le programme UNLOCK.
Partenaire de consortiums européens, la plateforme contribue au développement des technologies d’analyses de biopsie liquide, affirmant son rôle central dans la médecine personnalisée et la recherche translationnelle en oncologie.
Nos services
Les services de la plateforme sont ouverts à tous, en interne à Gustave Roussy comme aux équipes extérieures. Le porteur de projet est invité à présenter celui-ci lors d’une réunion dédiée : ses faisabilités scientifique, technique et financière y sont alors discutées et validées, sous condition de l’acceptation d’un devis prévisionnel.
Service 1
Détection et numération de CTC après méthodes d’enrichissement ou directement dans le sang total.
Technologies : CellSearch, RosetteSep, Marquages immunofluorescents, ISET, Parsortix, Microscopie, Cytométrie en flux.
Application : Suivi longitudinal du compte total de CTC détectées à différents moments du parcours clinique des patients, Évaluation de la corrélation entre ces comptes de CTC et les résultats cliniques.
Caractérisation phénotypique des CTC détectées : Analyses multi-protéines (cibles thérapeutiques, récepteurs de tyrosine kinase, voix de signalisation, réparation de l’ADN).
Technologies : Marquages immunofluorescents, Microscopie, Cytométrie en flux conventionnelle, Cytométrie spectrale en cours de développement.
Applications : Estimation de la bio-activité des traitements, Prédiction précoce de la sensibilité ou la résistance aux thérapies, Etude de la progression tumorale.
Isolement des CTC détectées en cellules uniques.
Technologies : Cytométrie en flux.
Application : Stockage des CTC en vue d’analyses moléculaires ultérieures.
Analyses transcriptomiques des CTC à l’échelle de cellules uniques, en cours de développement.
Technologies : 10x Genomics, Smart-Seq, Pipelines bio-informatiques robustes assurant qualité et précision.
Applications : Validation et complément des biomarqueurs protéiques détectés dans les CTC, Etablissement d’un pipeline protéomique/transcriptomique complet, Evaluation de biomarqueurs prédictifs de la réponse aux traitements, Etude de la progression tumorale.
Caractérisation génomique des CTC détectées et isolées en cellules uniques : Analyses du nombre de copies de gènes, analyses des mutations.
Technologies : Amplification du génome entier et contrôles de qualité associés, Séquençage « LowPass whole genome » de nouvelle génération, Séquençage ciblé de nouvelle génération avec un panel cancer commercialisé (60 gènes), Pipelines bio-informatiques robustes assurant qualité et précision.
Applications : Validation de la nature tumorale des CTC détectées et isolées, Analyse de l’hétérogénéité tumorale, Etablissement d’un score d’instabilité tumorale, Identification d’oncogènes drivers, Évaluation de la corrélation entre ces altérations génomiques et les résultats cliniques, Etude de la progression tumorale.
Développement de projets innovants comme les xénogreffes à partir de CTC (CDX) chez les souris ou encore la culture de cellules tumorales sur membrane chorioallantoïque (CAM) de l’embryon de poulet.
Technologies : Expérimentations animales, Imagerie du petit animal.
Applications : Modélisation des tumeurs, Analyse du processus métastatique, Test de l’activité thérapeutique.
Nous contacter
Si vous envisagez de nous confier une analyse, contactez-nous pour en savoir plus sur les options disponibles, définir la prestation, et établir un devis : GD-BCC@gustaveroussy.fr
Equipe
OULHEN Marianne - Responsable opérationnel plateforme
Ingénieur de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
BEUSCART Noémie
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
PAWLIKOWSKA Patrycja
Ingénieur de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
CAMARA Kousso
Autre statut dont apprenti
Employeur : Gustave Roussy
SANCHEZ-BECERRA Maria Virginia
Doctorant
Employeur : Gustave Roussy
COURTOIS Arthur
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
Publications clés
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